2024年2月27日，国家感染性疾病临床研究中心/深圳市第三人民医院张国良、卢水华团队，联合深圳华大基因吴靓团队、广西胸科医院刘爱梅团队，利用单细胞测序技术成功绘制HIV-1/Mtb共感染人群肺脏“区域”免疫图谱，为深入阐明HIV-1感染人群结核发病的免疫机制奠定理论基石。相关研究成果发表在美国传染病学会（IDSA）旗下杂志Journal of Infectious Diseases，题为“Uncovering the Bronchoalveolar Single-Cell Landscape of Patients With Pulmonary Tuberculosis With Human Immunodeficiency Virus Type 1 Coinfection”（DOI：10.1093/infdis/jiae042）。
HIV-1感染是导致结核发病的最重要危险因素。由于临床样本采集方面的挑战，大多数宿主抗结核免疫的研究主要集中在外周血，而外周血主要反映全身免疫反应，不能真实的反映出肺部的“区域”免疫特征。肺部区域免疫应答对于遏制结核分枝杆菌的生长和防止疾病的进展至关重要，对肺部区域免疫应答的全面解析对于更好地了解HIV-1/Mtb合并感染的发病机制至关重要。本研究共招募肺结核（TB）患者和HIV-1/Mtb共感染患者，通过支气管镜技术收集患者的肺泡灌洗液（BALF），并立即进行单细胞分离。利用华大自主研发的便携式DNBeLab C4单细胞处理系统对进行单细胞转录组文库制备，并在华大自主研发的测序仪DIPSEQ T1上进行测序。
该研究通过单细胞测序技术详细描绘了HIV-1/Mtb共感染和单纯TB患者肺泡灌洗液中的免疫细胞图谱。进一步根据差异表达的标识基因，将髓系细胞和T/NK细胞分别细分为10个细胞亚群。研究发现HIV-1感染显著降低结核患者肺部CD4+ T细胞和DCs细胞的比例，但显著提高CD8+ T细胞的比例。同时该研究表明HIV-1/Mtb共感染患者中的T细胞表现出更强的抗病毒活性，表明HIV-1感染不仅影响结核患者肺部免疫细胞亚群的分布特征，更影响免疫细胞的效应功能。
该研究得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、广东省特支计划、深圳市科技计划以及广西省科技计划的支持。国家感染性疾病临床医学研究中心/深圳市第三人民医院肖国辉副研究员，华大基因黄外东、钟裕博士，深圳市第三人民医院欧敏助理研究员为本文共同第一作者。
